Вообще ничего не выводится? Судя по вашему коду, должен выводится весь файл (echo $line."<br>";). Раз и этого нет, то явно ошибка открытия файла. Задайте полный путь до файла, а не относительный и поставьте проверку на открытие файла.
[PHP]<?php

$word = $_GET['word'];

$FL = fopen("1.txt", "r");
if (!is_resource($FL)) {
die("Ошибка открытия файла");
}

while (!feof($FL)) {
$line = fgets($FL);
echo $line."<br />";
if ($word == $line) {
echo "Слово найдено";
}
}

fclose($FL);

?>[/PHP]

fgets() разве не возвращает строку в конце с \r\n ?
искать надо при помощи strstr()

ой...ну слова из файла выводятся....не выводится "Слово найдено" =>значит оно не ищет(

Функция strstr — Находит первое вхождение подстроки

тоесть у меня в файле
cat
wolf


если я вместо cat напишу ываывcat и потом в поиск введу cat,то оно мне выведет ываывcat хотя это вовсе не cat...

а как отсечь символы \r\n ???

[PHP]trim($line)[/PHP]

Я бы лично сделал так, (ЕСЛИ ФАЙЛ НЕ ОЧЕНЬ БОЛЬШОЙ!!!)
[PHP]
$file = file('1.txt');
foreach($file as $v){
if($v == $_GET['words']){
$slovo = $v;
break;
}
}
if($slovo){ echo "YES SEARH"; }
else{ echo "NO!!!"; }
[/PHP]

Mulder, может Вы случайно забыли, trim без дополнительных аргументов удалит только пробелы
[PHP]
trim($text, '\n');
[/PHP]

ну вот что получилось
[PHP]<?php

$word = $_GET['word'];
$FL = fopen("1.txt", "r");
if (!is_resource($FL)) {
die("Ошибка открытия файла");
}

while (!feof($FL)) {
$line = fgets($FL);
if (trim($line, "\r\n")==$word) {
echo "Слово найдено: ".$line;
}
}
fclose($FL);
?>
[/PHP]

всем спасибо)

Всегда читайте документацию перед подобными заявлениями :) .